Egy napon kártyák kezdtek hullani az égből, melyeket gyerekek gyűjtöttek össze a világ minden táján. Minden kártyát más és más karakter, környezet és erő jellemezte. A gyerekek ezután kitaláltak egy harcos játékot, ami hamar népszerűvé vált világszerte. Azonban nem sejtették, hogy a kártyák egy alternatív világnak, Vestoriának felelnek meg. A játékosok közül mindezidáig 6 gyerek magasodott ki: Dan, Marucho, Runo, Shun, Julie és Alice. Ők nevezték el a szörnyeket Bakugannak, és elit csapatukat pedig Bakugan Szörny Bunyósokként emlegetik.

Vestroia egy hatalmas dimenzió, amit 6 elem alkot: Tűz, Föld, Fény, Sötétség, Víz és Szél. Ennek az univerzumnak a központjában két ellentétes energiaforrás áll: a végtelen mag, minden pozítiv energia forrása és... a csendes mag, minden negatív energia forrása. Az idők kezdete óta ez a két szembenálló erő biztosította az egyensúlyt Vestroiaban.

De volt egy gaz Bakugan aki hatalomra vágyott és tervet szőtt, hogy minden erő az övé legyen. Az ő neve Naga volt és célja, hogy behatoljon a csendes magba és megszerezze az erejét.

Ezalatt a földön egy Michael nevű tudós egy dimenziók közötti ugrásra alkalmas gépen dolgozott. A gép tesztelése közben, egy robbanás Vestroiaba juttatta, ahol felfedezte a két energia forrást. Mialatt próbált visszatérni a földre, a csendes mag gonost energiája rabul ejtette és a "Hal G" ként ismert gonosszá vált. Míg Vestroia-ban volt, Hal G megismerte a Bakugan Nagat, és alkut kötöttek - Hal G Naganak adja az emberi világot a Vestroiáért!

Naga végül elérte célját, a csendes magot és elkezdte a negatív energiáját magába szívni. De a negatív energia kezelése túl nagy feladatnak bizonyult Naga számára. A negatív energia felrobbant és a végtelen mag a földre hullott. Vestoriában kitört a zűrzavar, a negatív energia eluralkodott az ott élő Bakuganok elméjében és akaratában.

Ahogy Vestroia elkezdett összeomlani, az az emberi világot is érintette. A "végtelen mag" és a "csendes mag" akadályoztás egymást és elkezdtek vad dolgok történni. Most már Dan-en és a szörny bunyósokon múlik, hogy megtalálják a végtelen magot és egyesítség a csendes maggal, hogy visszatérjen az egyensúly. Amit ezek a fiatal harcosok először csak játéknak gondoltak, az mostanra az univerzum békéjéért folytatott harccá vált!

Szereplők

• Daniel "Dan" Kuso: Ő az a bakugan-harcos, aki Pyrus elemű bakuganokat használ. Beszélő Bakuganja: Drago. Drago továbbfejlődött formái: Delta Drago, Neo Drago, Ultra Drago. Magyarországon Moser Károly szinkronizálja, japán hanga pedig Kobajasi Ju.

• Runo Misaki: Ő az a bakugan-harcos, aki haos elemű bakuganokat használ. Bakuganja: Tigrerra,Blade Tigrerra.

• Shun Kazami: Ő az a bakugan-harcos, aki ventus elemű bakuganokat használ. Bakuganja: Skyress Storm Skyress Japánban Szudzuki Csihiro hangján szólal meg, a magyar változatban pedig Baráth István szinkronizálja.

• Julie Makimoto: Ő az a bakugan-harcos, aki subb terra elemű bakuganokat használ: Bakuganja: Gorum,Hammer Gorum.

• Marucho Marukuro: Ő az a bakugan-harcos, aki aquos elemű bakuganokat használ: Bakuganja: Preyas,Preyas Angelo,Preyas Diablo.

• Álarcos: Ő az a bakugan-harcos, aki darkros elemű bakuganokat használ. Bakuganja: Hydranoid. Hydranoid továbbfejlődött formái: HM Alpha Hydranoid, Dual Hydranoid

• Alice Gehabich: Ő nem Bakuganozik, de többet tud a játékról, mint bárki más.

• Michael Gehabich/Hal-G: Alice nagyapja. Az álarc készítője. Szövetkezik Nagával. És ő áll Vestroia elpusztítása mögött.

• Naga: Gonosz Bakugan. El akarja pusztítani Vestroiát és Drágót.

• Clayf: Subterra legendás harcosa.

• Frosch: Aquos legendás harcosa.

• Lars Lion: Haos legendás harcosa.

• Oberus: Ventus legendás harcosa.

• Apollonir: Pyrus legendás harcosa.

• Exedra: Darkus legendás harcosa.